电影《大爆炸》的故事发生在一个刚刚遭受台风袭击后的现代化沿海城市。市长吴刚在一天早上八点接到犯罪团伙头目陆天豪的恐吓电话，声称他们发现了五十多年前国民党逃离大陆前遗留下的一个巨大的秘密地下弹药库，并威胁如果不释放他们的同伙——大毒枭“黑雕”，就会引爆弹药库摧毁整个城市。
面对这一危机，吴刚立即召集相关专家和人员进行调查并商讨对策。同时，他的妻子赵玫因涉嫌受贿被机场警方截获，这使得情况更加复杂。省委联合调查小组和专案组组长、市委副书记钟平对此事也十分关注，陷入了深思之中。
为了应对犯罪团伙的威胁，避免灾难性的大爆炸，吴刚表面上假装答应罪犯的要求，实际上则暗中组织力量寻找阻止爆炸的方法。然而，事情并没有那么顺利。一艘装载危险物品的外籍货轮“巨鲨号”由于违章行驶，船员不小心引发火灾，破坏了货舱内的温控系统，导致货舱温度迅速升高，随时可能引发爆炸。
在这个关键时刻，吴刚的妻子赵玫在接受隔离审查时突然跳楼自杀。随后，钟平的儿子钟磊无意间得知了即将发生的大爆炸的消息，并通过网络将其传播出去，引起了全城的恐慌。最终，整个城市拉响了撤离警报，开始了前所未有的大规模撤离行动。
故事以这座城市能否成功化解危机，以及吴刚和钟平是否能够将犯罪分子绳之以法作为悬念，留给观众无限的遐想空间。这部电影通过紧张刺激的情节设置，展现了正义与邪恶之间的较量，同时也反映了个人命运与公共安全之间的冲突与挑战。
